MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022784	T	6	6	54420	54425	0 %	100 %	0 %	0 %	557625345
1002	NC_022784	ATC	2	6	54443	54448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625345
1003	NC_022784	TA	3	6	54527	54532	50 %	50 %	0 %	0 %	557625345
1004	NC_022784	CCTT	2	8	54651	54658	0 %	50 %	0 %	50 %	557625345
1005	NC_022784	GCA	2	6	54732	54737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625345
1006	NC_022784	AT	4	8	54764	54771	50 %	50 %	0 %	0 %	557625345
1007	NC_022784	TAT	2	6	54787	54792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625345
1008	NC_022784	CT	3	6	54960	54965	0 %	50 %	0 %	50 %	557625345
1009	NC_022784	ACG	2	6	54976	54981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625345
1010	NC_022784	CCGC	2	8	54993	55000	0 %	0 %	25 %	75 %	557625345
1011	NC_022784	AGC	2	6	55001	55006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625345
1012	NC_022784	G	6	6	55051	55056	0 %	0 %	100 %	0 %	557625345
1013	NC_022784	A	6	6	55107	55112	100 %	0 %	0 %	0 %	557625345
1014	NC_022784	T	6	6	55132	55137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022784	AGA	2	6	55138	55143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_022784	AAT	2	6	55154	55159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022784	GGCTA	2	10	55211	55220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1018	NC_022784	ATA	2	6	55424	55429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022784	TCC	2	6	55445	55450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_022784	GTAC	2	8	55536	55543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_022784	ATA	2	6	55547	55552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022784	TGC	2	6	55632	55637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_022784	GAT	2	6	55691	55696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022784	CG	3	6	55702	55707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_022784	GGA	2	6	55768	55773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022784	ACA	2	6	55786	55791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_022784	GC	3	6	55792	55797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_022784	AACC	2	8	55857	55864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_022784	GC	3	6	55969	55974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_022784	CAG	2	6	56091	56096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_022784	TGG	2	6	56149	56154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_022784	CAG	2	6	56214	56219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_022784	TCT	2	6	56246	56251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_022784	GAT	2	6	56256	56261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022784	GCT	2	6	56333	56338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_022784	AGG	2	6	56347	56352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022784	GCA	2	6	56354	56359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_022784	CGG	2	6	56444	56449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_022784	G	6	6	56508	56513	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022784	GGA	2	6	56529	56534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022784	A	6	6	56565	56570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022784	ACAG	2	8	56596	56603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_022784	CCG	2	6	56693	56698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_022784	TGA	2	6	56763	56768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022784	GCA	2	6	56770	56775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_022784	C	6	6	56776	56781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_022784	GCA	2	6	56837	56842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_022784	GTG	2	6	56908	56913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_022784	CGA	2	6	56943	56948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_022784	CAG	2	6	56962	56967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_022784	GA	3	6	57008	57013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_022784	GCAC	2	8	57081	57088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_022784	GGA	2	6	57168	57173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022784	TGG	2	6	57207	57212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022784	TTA	2	6	57282	57287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022784	CT	3	6	57300	57305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_022784	GTG	2	6	57340	57345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_022784	ATT	2	6	57352	57357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022784	CGCA	2	8	57500	57507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_022784	CCAT	2	8	57555	57562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_022784	ACA	2	6	57590	57595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_022784	GCT	2	6	57640	57645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_022784	AAG	2	6	57680	57685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022784	TGGG	2	8	57872	57879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022784	TAC	2	6	57916	57921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_022784	ATG	2	6	57932	57937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022784	T	6	6	57947	57952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022784	AGG	2	6	58031	58036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022784	AGA	2	6	58074	58079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022784	GCC	2	6	58150	58155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_022784	AC	3	6	58198	58203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_022784	TAG	2	6	58221	58226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_022784	GAT	2	6	58249	58254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022784	GCC	2	6	58260	58265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_022784	AC	3	6	58266	58271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_022784	TGG	2	6	58275	58280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022784	GCA	2	6	58323	58328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_022784	CCA	2	6	58349	58354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_022784	GAT	2	6	58378	58383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022784	GA	3	6	58553	58558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_022784	AGAGA	2	10	58645	58654	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022784	CT	3	6	58667	58672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_022784	CTT	2	6	58788	58793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_022784	GAT	2	6	58798	58803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_022784	TGGC	2	8	58835	58842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_022784	ACA	2	6	58883	58888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_022784	GGT	2	6	59238	59243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_022784	ATG	2	6	59300	59305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022784	TTG	2	6	59327	59332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_022784	ACAG	2	8	59467	59474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_022784	A	6	6	59482	59487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022784	CA	3	6	59490	59495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_022784	GCA	2	6	59511	59516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_022784	TAG	2	6	59585	59590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_022784	GCT	2	6	59604	59609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022784	ATGA	2	8	59668	59675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022784	TTG	2	6	59702	59707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022784	TGG	2	6	59739	59744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_022784	GAC	2	6	59758	59763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_022784	ACG	2	6	59810	59815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_022784	GCA	2	6	59874	59879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_022784	CGC	2	6	59901	59906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_022784	ATG	2	6	59912	59917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022784	TC	3	6	59992	59997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_022784	GTT	2	6	60028	60033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022784	AT	3	6	60163	60168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022784	AGT	2	6	60237	60242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022784	TTG	2	6	60329	60334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022784	GCA	2	6	60335	60340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_022784	GC	3	6	60377	60382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_022784	GAT	2	6	60412	60417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022784	GTGCA	2	10	60425	60434	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1113	NC_022784	TGC	2	6	60443	60448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_022784	AGA	2	6	60633	60638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_022784	AC	3	6	60677	60682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_022784	AGC	2	6	60695	60700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_022784	GACAA	2	10	60724	60733	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_022784	CA	3	6	60778	60783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_022784	CA	3	6	60807	60812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_022784	GTG	2	6	60826	60831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022784	GTA	2	6	60857	60862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022784	GAT	2	6	60865	60870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022784	GAT	2	6	61066	61071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022784	TGA	2	6	61074	61079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022784	GCG	2	6	61085	61090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022784	AGA	2	6	61182	61187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_022784	AC	3	6	61217	61222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_022784	GAA	2	6	61306	61311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022784	CGG	2	6	61431	61436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_022784	AGC	2	6	61476	61481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_022784	TG	3	6	61534	61539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022784	CCT	2	6	61653	61658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_022784	CTA	2	6	61668	61673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_022784	AT	3	6	61727	61732	50 %	50 %	0 %	0 %	557625346
1135	NC_022784	CCT	2	6	61772	61777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625346
1136	NC_022784	GAC	2	6	61792	61797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625346
1137	NC_022784	CTT	2	6	61873	61878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625346
1138	NC_022784	AAT	2	6	61888	61893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625346
1139	NC_022784	CTT	2	6	61939	61944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625346
1140	NC_022784	CCT	2	6	62020	62025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625346
1141	NC_022784	TGG	2	6	62219	62224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_022784	GTT	2	6	62228	62233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_022784	GT	3	6	62264	62269	0 %	50 %	50 %	0 %	557625347
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1149	NC_022784	GGTA	2	8	62661	62668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_022784	CTG	2	6	62678	62683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625348
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1163	NC_022784	CCT	2	6	63267	63272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1164	NC_022784	GTTG	2	8	63273	63280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_022784	GTA	2	6	63310	63315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_022784	GCT	2	6	63322	63327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1178	NC_022784	TGC	3	9	63930	63938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1179	NC_022784	AG	3	6	63981	63986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1180	NC_022784	TTG	2	6	64015	64020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1182	NC_022784	GCA	2	6	64299	64304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1183	NC_022784	GGC	2	6	64311	64316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1218	NC_022784	TC	3	6	65850	65855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1222	NC_022784	TCT	2	6	67026	67031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1224	NC_022784	TCT	2	6	67113	67118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1225	NC_022784	ACT	2	6	67168	67173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1226	NC_022784	CTT	2	6	67176	67181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1232	NC_022784	TAGGG	2	10	67566	67575	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1233	NC_022784	TG	3	6	67608	67613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1238	NC_022784	CTG	2	6	67891	67896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1243	NC_022784	AG	3	6	68215	68220	50 %	0 %	50 %	0 %	557625350
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1250	NC_022784	N	162	162	68598	68759	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_022784	GT	3	6	68760	68765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_022784	GA	3	6	68784	68789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_022784	GTGA	2	8	68816	68823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_022784	GTG	2	6	68838	68843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_022784	GTT	2	6	68989	68994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_022784	T	6	6	68993	68998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_022784	AAGA	2	8	69028	69035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_022784	AGC	2	6	69122	69127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625351
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1262	NC_022784	TAG	2	6	69215	69220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625351
1263	NC_022784	TTG	2	6	69416	69421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625351
1264	NC_022784	TAG	2	6	69455	69460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625351
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1267	NC_022784	GGT	2	6	69664	69669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625351
1268	NC_022784	AAAGAC	2	12	69727	69738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	557625351
1269	NC_022784	GTC	2	6	69769	69774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625351
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1271	NC_022784	GGA	3	9	70071	70079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625351
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1397	NC_022784	TGGGG	2	10	77302	77311	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_022784	N	55	55	77509	77563	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_022784	GAG	2	6	77586	77591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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